중앙대학교의료원은 본래 의과대학부속필동바카라 룰(서울특별시 중구 필동 2가 82-1)과 의과대학부속용산바카라 룰(서울특별시 용산구 한강로 3가 65-207)으로 구성되었다.

1968년 5월 당시 가톨릭의과대학의 임상과장급 교수들의 일부가 중심이 되어 창립한 200병상 규모의 성심바카라 룰(聖心病院)이 그 전신이며, 1970년 9월 25일 학교법인 중앙문화학원이 인수하여 중앙대학교의과대학부속바카라 룰으로 개편하였다.

1984년 7월 1일용산구 한강로에 있던 서울철도바카라 룰(국립서울바카라 룰)도 임차하여 중앙대학교의과대학부속용산바카라 룰으로 운영하였다. 1985년에 들어서 중앙대학교 의료원 체제로 발족하여 의료원 아래 위의 두 개의 바카라 룰을 운영하였다.

1987년 국내 최초로 체외충격파 신쇄석기실(ESWL)를 가동하였다. 1998년 12월 말 당시 의과대학부속필동바카라 룰은 15개 진료과에 400병상 규모를 갖추었으며, 의과대학부속용산바카라 룰은 16개 진료과에 440병상을 갖추었다.

연구기관으로 한국의과학연구소를 개설하여 연구지 『한국의과학』을 계간으로 발행하였다. 1998년 12월 말 당시 의과대학부속필동바카라 룰은 전문의 55명, 간호사 218명 등 614명의 직원이 근무하였으며, 의과대학부속용산바카라 룰에는 전문의 65명과 간호사 236명 등 679명의 직원이 근무하였다.

2005년 1월 18일 중앙대학교부속필동바카라 룰이 서울특별시 동작구로 이전을 완료해서 중앙대학교바카라 룰으로 명칭을 변경하였다. 이후 2011년 3월 30일에 중앙대학교부속용산바카라 룰이 흑석동 중앙대학교바카라 룰에 통합되었다. 현재 중앙대학교바카라 룰은 서울특별시 동작구 흑석로 102(흑석동 224-1)에 위치해 있다. 2014년 현재 17개 병동, 845개 병상, 202개 병실을 갖추고 있으며, 120여명의 의료진과 700여명의 간호사가 근무하고 있다. 2021년 3월 의료원 산하에 중앙대학교 광명바카라 룰을 개원하였다.