고려대학교 의과대학·의과대학부속토토 랜드·의학도서관·의과학연구소 등을 조정, 통괄하기 위하여 1983년 9월에 발족되었으며, 현재 산하에 고려대학교 의과대학부속 안암토토 랜드·구로토토 랜드·안산토토 랜드의 3개 토토 랜드을 두고 있다.

고려대학교 의과대학 부속토토 랜드은 1941년 9월 경성여자의학전문학교의 부속토토 랜드으로 개원하여, 그 뒤 30여년간 학교법인 우석학원에서 경영하여 왔다. 그 사이 토토 랜드의 명칭이 1948년 서울여자의과대학 부속토토 랜드, 1957년 수도의과대학 부속토토 랜드, 1967년 우석대학교 의과대학 부속토토 랜드으로 바뀌었고, 1971년 12월 현 학교법인 고려중앙학원에 합병됨에 따라 토토 랜드의 명칭도 고려대학교 의과대학 부속 우석토토 랜드으로 바뀌었다.

1983년 9월 토토 랜드의 명칭을 부속 혜화토토 랜드으로 고치는 동시에 부속 구로토토 랜드을 개원한 다음 고려대학교의료원을 정식으로 발족하였다. 1985년 4월 부속 반월토토 랜드을 개원하고, 1986년 5월 반월토토 랜드을 부속 안산토토 랜드으로 바꾼 뒤 1998년 9월 외상센터 등을 갖춘 600병상 규모로 증축, 개원하였다.

의료원에는 행정부서로 기획조정실·교육연구수련부·사무국과 운영위원회 등 18개 제위원회를 두고 있으며, 각 부속토토 랜드에는 진료부와 필요한 관리부서를 두고 있다. 1991년 10월 혜화동시대를 마감하고 모토토 랜드 부속 안암토토 랜드은 800병상으로 신축 이전, 새 안암동시대를 열었다.

1998년 12월 현재 각 부속토토 랜드의 병상수는 구로토토 랜드 600병상, 안산토토 랜드 600병상 규모이다. 의료원에서는 1년에 한차례 ≪고려대학교의료원연보≫와 격월간으로 원내외보인 ≪고대의료원보≫와 원내 소식지를 발간하고 있다.